药学院下设四个研究方向，具体如下：

方向一 特色资源驱动的天然药物创新

依托喀斯特地区特色中药民族药资源，构建“资源勘探-成分挖掘-机制解析-系统开发”的创新链条，打造区域特色鲜明的天然药物研发体系。挖掘高活性药用新成分，探明作用机制、开展系统性开发。针对其中活性显著且含量稀少的天然药物，如混源萜、生物碱、糖类等，开展融合合成生物学和现代合成化学的智能化、规模化合成。

方向二 新机制导向的智能药物发现

瞄准代谢、感染及肿瘤等重大疾病的防治需求，以“新机制探索-新靶标验证-智能创制”为核心路径，提升药物研发的源头创新能力与转化效率。

方向三 代谢调控驱动的药物分析与安全性评价

融合药物分析与代谢毒理技术，构建“分析检测-代谢解析-毒性评估-安全优化”一体化技术体系，为新药创制和健康管理提供支撑。

方向四：智能药物递送与诊疗一体化

聚焦药物递送过程中的“精准靶向、可控释放”等关键挑战，构建“智能载体设计-体内转运调控-诊疗一体化应用”的完整技术体系。